河里，一具女尸如同油画《奥菲利亚》中的模样漂浮在水中，死者为话剧女演员李菁菁（孟子叶饰），经法医韩枚（赵崔玮饰）鉴定，死者身体被掏空，溺水而死。如此凶残的行凶手法，引起了所有人的关注。凶手先后锁定在和女演员生前有染的话剧团导演和剧务，然而双方都有不在场证据，令案件一时陷入了僵局。此时，女法医给出了一个惊人的答案，令所有人无法相信，死者的哥哥悲痛欲绝，誓言要展开报复。而此时真正的凶手却在酝酿着一场更大的阴谋。
为了寻找在派对中失踪的大学生，两名携带录像设备的私家侦探闯入了一幢空房子，并在其中发现数卷神秘录影带：1）男人米德尔顿植入了能记录影像和声音的义眼，他在家中却看到恐怖的影像；2）在国家公园丛林里骑车的麦克碰到一个满身伤痕、呕吐黑水的女人，接下来一群恐怖丧尸慢慢向他靠近。被丧尸咬了后，男子的身体渐渐发生变化；3）某剧组造访一个神秘教派，天堂般美好的表象下，恐怖气息蔓延，他们偏偏赶上魔王降临人间；4）父母不在的湖边住宅，孩子们放肆玩耍。夜深人静之际，强烈的光芒突然闪过，神秘生物进入屋内，意外频现。 诡异的录影带，将观看者引向黑暗深处……
由于两年前揭发同僚贪污，台北警官黄火土（梁家辉）被上级报复调入冷门的外事组工作，利益也曾连带受损的新同事对他怒言相向，加上妻子清芳（刘若英）受不了他长期不回家要求离婚，黄火土感觉他的世界正在逐渐四分五裂。 就在此时，三宗受害者的身份并无关联的震惊了台湾社会的离奇命案发生，法医（杨贵媚）验尸发现他们都是因中一种神秘的黑霉菌产生幻觉而死，因为缺乏此方面的人才，当局从美国请来此种案例的侦办专家凯文莱特（David Morse）协助破案，黄火土重被任用。随着一桩令所有人都目瞪口呆的事实的被发现，一场围绕政治利益与民众利益的斗争也在黄火土和办案伙伴李丰博（戴立忍）及整个警察队伍之间展开。
