一天，工藤大器偶然听到了神秘声音的呼唤，与朋友们一起来到了数码世界，在那里认识了众多的数码兽同伴并且成为指挥官建立“Xros Heart”团队。意想不到的是，在数码世界中除了他们外竟然还有别的人类在数码世界中活跃着……然而，为了防止邪恶的巴古拉军企图称霸数码世界，他们将要努力地收集水晶（Code Crown）来保护各个领域（Zone），担负起拯救数码世界的命运。
　　被巴古拉兽击回到人类世界的工藤大器和高吼兽，经过东京大决战留在人类世界一天后，相对地数码世界已经过了好几个月的时间，并落入了巴古拉军支配下的地狱世界，分裂为七个国家（Land），由七名巴古拉军手下的死亡指挥官所统治，而这七名死亡指挥官就是本篇章的主要敌人。为了让数码世界再次得到和平，工藤大器和高吼兽决定再次回到危机四伏的数码世界中。此外，本篇章亦出现全新力量“超进化”。
　　与巴古拉兽的最终决战已经过去了一年，天野音音的弟弟-天野悠入读大器所读的中学，并与大器组成“Xros Heart”的篮球队，过着悠闲的生活，而队伍中还有一名尊敬著大器学长的成员-明石激。一天，明石激被卷入了“数码晶界”所发生的异变之中。

　　大门大意外地遇到了亚古兽，两人见面就大打出手，亚古兽战败后称大门大
　　为大哥，但是数码特搜部队（DATS）不容许未受其队员管理的数码兽留存在这个世界上，必需送回数码世界，而后汤岛告诉大若加入DATS他就可以跟数码世界的强敌战斗，大因此加入DATS，与淑乃及托玛组成小组，一同解决数码事件。
　　托玛发现日本的数码事件频率增加并非偶然，因此请假回到欧洲调查，发现根源来自于人类的七宗罪。而比丘兽的事情让大他们知道了其幕后黑手是究极体数码兽——墨丘利兽搞的鬼，也因此决定动身前往数码世界。而在数码世界，他们见到了一个人类小孩——郁人，他自称数码兽，对人类怀有怨恨。
　　历经艰难以后和汤岛老人会合并见到了墨丘利兽，墨丘利兽指责人类没有遵守约定，严重干扰了数码世界的秩序，对数码兽实施残酷的杀戮，然而汤岛却一再强调人类什么事情都没有做。最后谈判破裂，汤岛一面努力制造混乱局面，一面把大一行人送回了人类世界
　　，自己却留在了数码世界。回到人类世界的大家决定去见见郁人的父母。
　　在见到郁人的父母后，郁人拒绝承认自己人类的身份，在大的开导下，他才准备融入这个家庭，并希望回到数码世界，跟墨丘利兽告别。然而等待他们的，却是墨丘利兽的死亡，而杀死它的，就是曾经和大的父亲，郁人的父母以及汤岛、萨摩一同前往过数码世界的仓田。最后，大门大为DATS中唯一一位留在数码世界者

　　2002年，数码世界面临灭亡的危机！数码世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃……
　　古代曾经拯救数码暴龙世界的十斗士现在已不存在。就在这危急关头，十斗士的斗士精神把新力量给予了另一个世界——现实世界的孩子……
　　主角拓也等人，将进入数码世界，变身成数码暴龙，投入这场冒险与战斗的旅程！

　　松田启人（津村真琴 配音）是一个热爱幻想的五年级男生，一次偶然中，启人捡到了一张神奇的卡片，这张卡片将启人带往了生活着数码兽的数码世界，在那里，启人遇见了基尔兽，此时的他并不知道，基尔兽将会是他一生中最重要的搭档和朋友。
　　为了保护数码世界和数码兽，四圣兽之一朱雀兽接连不断的将帝魔送往人类世界，造成了危险和混乱，启人和好友牧野留姬（折笠富美子 配音）、李健良（山口真弓 配音）一起为了保护和平加入了战斗之中。不仅如此，朱雀兽还带走了掌握着数码兽进化关键的古乐兽，追随着古乐兽的踪迹，启人一行人闯入了数码世界，展开了大冒险。

　　在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。
　　数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……

　　1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。
　　11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……

　　雪男は燐に決別を告げ、イルミナティへと向かってしまった。
　　強さを求め、真実を求める雪男と向き合うためには、
　　自分たちの出生の秘密を知る必要があると決意した燐は、
　　メフィストの手引きで過去へと旅立つ。
　　燐は、育ての父である藤本獅郎と実の母である
　　ユリ・エギンの足跡を辿っていくが、
　　二人が生きた道筋は、想像を超える過酷なものだった――
　　なぜ、悪魔の神であるサタンと
　　人との間に仔が生まれたのか。
　　〝青い夜〟とは何だったのか。
　　すべてを知ったとき、燐が出す答えとは……。
　　物語はいよいよ「青の祓魔師」の核心を暴き出す――

　　遥か神話の時代より繰り広げられた、善と悪の戦い…。「善神アーガマ」の血を受け継ぐ「大牙剣」は、現代に復活した「邪神ドラゴ」の末裔「女帝ザーラ」率いる「ドラゴ帝国」から人々を、世界を救う為、「バイオアーマー」「獣神ライガー」と一体化して戦う…。

　　兽拳，乃是感受野兽之心，发挥出野兽力量的拳法，诞生于古代中国，拥有四千年的历史。兽拳可区分成两个派门，一个是正义的激兽拳，一个是邪恶的临兽拳。为了阻止临兽拳重现人间后支配世界，激兽拳在运动用品会社SCRTC支持下，组成激气连者和临兽拳对抗。

　　Bubblegum Crisis 1987的OVA，共8集
　　企画、原作 - 鈴木敏充
　　監督 - 秋山勝仁（PART1 - 4）、大張正己（PART6）、合田浩章（PART8）
　　監修 - 秋山勝仁（PART5）
　　スーパーバイザー - 荒牧伸志（PART4・5）
　　ディレクティブアドバイザー - 越田啓文（PART6）
　　キャラクターデザイン - 園田健一
　　ゲストキャラクターデザイン - 合田浩章（PART5・6）、うるし原智志（PART7）
　　メカニックデザイン - 園田健一（PART1）、柿沼秀樹（PART1 - 3）、荒牧伸志（PART1 - 3）
　　メカニックデザイン補 - 山根公利（PART1 - 4）、夢野レイ（PART1 - 4）、嶽崎千尋（PART2・4）
　　プロダクションデザイン - 荒牧伸志（PART4・6 - 8）、夢野れい（PART5・7・8）、山根公利（PART6 - 8）、園田健一（PART8）
　　プロダクションデザイン補 - 山根公利（PART4）、夢野れい（PART4）、片桐潔（PART4）
　　グリフォンコンセプトデザイン - 横山宏（PART4）
　　K-12Sデザイン - 山根公利（PART5）
　　D-Dデザイン - 大張正己（PART5）
　　タイトル、リスワーク - マキ・プロ
　　美術監督 - 荒井和浩（PART1 - 5）、池田繁美（PART6）、南郷洋一（PART7）、平城徳浩（PART8）
　　撮影監督 - 高橋明彦（PART1 - 3・5・6）、小西一廣（PART4・7・8）
　　現像 - 東京現像所
　　音響監督 - 松浦典良
　　録音スタジオ - 整音スタジオ
　　音楽ディレクター - 藤田純二（PART2）
　　音楽 - 馬飼野康二
　　サウンドトラック盤 - 東芝EMI
　　音楽プロデューサー - 藤田純二（PART3 - 8）
　　制作プロデューサー - 渡辺欽哉（PART6・7）、八重垣孝典（PART8）
　　宣伝プロデューサー - 岡村英次（PART2 - 8）、田崎廣（PART2）
　　プロデューサー - 三浦亨（PART1）、青野武（PART2・3）、田崎廣（PART3・6 - 8）、小泉聴（PART8）

　　新闻报道了怪盗团事件嫌疑人的莲自杀的消息，同时怪盗团也开始暗中展开行动。
　　为了揪出策划所有事件的幕后人物并让其改过自新，怪盗团决心潜入新目标的魔宫，并盗出宝物。

　　在德川幕府时代，日本幕府统治开始走向没落，对农民的压迫也空前惨烈，其时又有西方宗教传入日本，忍无可忍之下，暴发了农民起义，许多天主教农民揭竿而起反对幕府的统治，史称“岛原之乱”，轰动了整个日本，大大地冲击了当时的当权者。
　　当时的起义在1638年暴发，以妖异少年天草四郎为首的天主教徒，聚集农民和天主教徒三万七千余人发动了起义，攻击德川幕府的各地政权。起义军开始时势如破竹，连连击败幕府军队，攻下了几座城池，而且影响越来越大，参加进来的农民逐渐增多。德川幕府紧急调动各地诸侯的兵力十二万镇压起义农民，起义军和幕府诸侯军队血战3个多月后终因寡不敌众而失败，起义军领袖、年青的天主教徒天草四郎也被幕府军队抓获，被判斩首示众，他死前却大声疾呼：我将像天主基督一样复活！
　　这个事件过去不久，天草四郎却真的复活了！负责保护幕府政权的是武林世家柳生家族，他们坚守自己的职责和天草四郎展开了或大或小的战斗。其中，武林家族柳生派的第一高手是柳生十兵卫，他的家族武术渊源甚深，对剑术尤其精湛，而天草四郎则不断锻炼妖异魔法，也具备常人无法企及的法力，他们两人都感受到了对方的威胁，正邪激战一触即发……
　　故事中天草四郎以妖术打开地狱之门，召唤宫本武藏、荒木又右卫门、宝藏院胤舜等历代豪杰的鬼魂从魔界复活，企图毁灭德川政权，与知名剑豪柳生十兵卫，展开一场鬼哭神号的正邪对决。