主人公·长菜奈寺美被同级生露理诱惑参加了同人志的贩售会。在那里奈寺美第一次接受到同人文化的冲击。在露理和已是同人界超级人气作家的幼年玩伴Justice的影响下，奈寺美也开始了自己的同人活动，不过由于完全是外行人，所以技术完全不行。不过奈寺美并没有因此而灰心，反而向着人气漫画家的方向努力前进，与各种奇怪的朋友一起过着充实的每一天。
在与暗之科学王国的战斗之后，千空一行人以让史丹利等人占领珀耳修斯号为代价，成功捕获了杰诺。为了躲避猛烈追击，千空一行人以石化光线发源地南美为目标启程！ 千空与杰诺决定短暂联手，结合彼此的知识，共同逼近那令人憎恶的「光」的真相！ 为了拯救人类的未来，千空将与伙伴们携手，全力开拓属于他们的「科学之道」！！
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