故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中，校长是严肃又寡言的碇原度（立木文彦 配音）。作为校长的儿子，碇真嗣（绪方惠美 配音）感到压力很大。于此同时，来自外国的红发转学生明日香（宫村优子 配音），分裂成三个、以姐妹的形式出场的凌波丽（林原惠美 配音）都给碇真嗣的学校生活带来了翻天覆地的变化。此外，在原作中高大帅气的初号机，也将以娇小可爱的形象，作为学院的一份子出现在动画中。
　　动画以《新世界福音战士》中的角色为原型，一改原作沉重严肃的气氛，描述了轻松愉快的校园生活。制作方首次采用了3D的Q版造型，配以实景背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格。

　　冢本天满是高中2年生。和许多的女孩子一样，她也在恋爱。但是，她一直没能向她非常喜欢的人——同班同学的乌丸大路表白爱意。
　　天不佑人！她突然知道了乌丸还有1年就要转校了这件事!!尽管如此，她还是得到了妹妹——八云和友人们的协助，为了告白一会化装成护士，一会试着发出箭书……还有一个喜欢这样的天满的高中2年生——播磨拳児(是个不良少年)。虽然也是那么的喜欢天满，但是和天满一样，无法向喜欢的人传达自己的爱意，过着消沉的每一天……
　　但是播磨在目击到天满和乌丸一起吃午饭后，伤心悲哀的他于是就拒绝去上学，开始了流浪的旅行……

　　2008年4月からは第3シリーズである『全国大会篇 Final』が全4巻で発売された。
　　Vol.0：   [0. 焼肉の王子様]
　　Vol.1：   [1. 頂上対決! ]、   [ 2. オレたちのやりかた]
　　Vol.2：   [3. 真昼に星は見えるか!? ]、  [4. 心をひとつに]
　　Vol.3：   [5. 最終決戦! 王子様VS神の子 ]、  [6. Dear Prince〜テニスの王子様達へ〜]

　　青春学园网球部称霸全国的目标又向前迈进了一步。代表中学网球最高水平的全国大赛开始了。之前饱受伤病困扰的部长手冢国光（置鲇龙太郎 配音）彻底愈合回归，而越前龙马（皆川纯子 配音）也从美国回到了日本，声称自己只是来加油的。青学迎战的第一场是来自冲绳的六角中学。六角中学故意伪造意外事故，让青学陷入了困境，为了能让青学获胜，大石（近藤孝行 配音）决定让龙马替自己征战。经过一番苦战，青春学园进入到了下一轮，而面对他们的是老对手——冰帝。这将是一番苦战！除此之外，之前在正片中出场的各大学校也将登场，进行最激烈的全国大赛。
　　本片改编自许斐刚的同名热门漫画全国大赛卷。

　　OVA一共5集。
　　私立莉莉安女子学院：
　　创立于明治34年，拥有很长历史传统，校风优雅的女子私立学校之名门。在武藏野辽阔富饶的土地上，坐落着此学院的幼儿园，小学，中学，高中，大学（文学部和家政部），研究生院。这个学校的传统就是贯彻淑女教育，培育谨慎谦恭，学识丰富，教养好的淑女。　在莉莉安女子学院，每一个一年级的新生都会被一个二年级的学姐选为“妹妹”，而这个学姐也会以“姐姐”的身份照顾选中的学妹，不管是学习还是生活上。这其实是一种一对一的监护人制度，而这种制度不但可以让新生更好的适应学院生活，同时也能促进不同年纪学生的交流，使学院更团结。当然，其中也有一些宗教的因素。在莉莉安女子学院中，学生会“山百合会”是由红、白、黄三个玫瑰家族掌控，因此玫瑰家族中每一个成员都是学生中的表率，也是其他学生崇拜的对象。而本作的主角福沢祐巳开始只是个平凡的新生，但却在阴差阳错之下被她一直崇拜的学姐，红玫瑰家族二年级的小笠原祥子选为妹妹，因此也展开了她不平凡的校园生活。在深入“山百合会”的同时，把一个个感人的故事带到了我们面前。本作的主题是女孩子们之间的感情，因此推荐给喜欢的朋友。

宫小路瑞穗（堀江由衣 配音）是个地地道道的男孩子，可是由于祖父的奇怪遗言，他即将转学到圣央女学院开始新的学习生活。祖父的用意为何？瑞穗完全不知道。圣央女学院是一所完全的女校，有其严明的校风和校规，是女孩子们学习如何成为一名真正淑女的宝地。对于从小就接受着良好教育的瑞穗来说，这一切都不是问题。唯一困扰着他的，是如何打扮成女生而不被发现，和怎样应付周围那一群如花似玉的大小姐。                                    
                               　　成熟端庄的十条紫苑（松来未佑 配音），单纯善良的周防院奏（神田朱未 配音），活泼好动的御门玛利亚（浅野真澄 配音），傲娇腹黑的严岛贵子（高桥智秋 配音），在这些可爱女孩的围绕下，想要守住身为男孩的秘密对于瑞穗来说几乎是不可能完成的任务。

　　13岁的安倍昌浩（甲斐田雪 配音），是日本最伟大的阴阳师安倍晴明的孙子，作为晴明唯一继承者的他却没有什么法力——他不能看见妖怪。当他想放弃阴阳师之路，努力培养别的才能时，一直形似白猫的神秘小妖怪出现在他身边。与此同时，京都妖孽横行，于是爷爷委托昌浩去击退妖魔。没有法力的昌浩只好带着这只小猫怪，作为自己“看见妖怪”的眼睛。几番恶斗后，昌浩击退了肆虐于京都里的妖魔，并恢复了多年前被封印的法力。同时，他也得知，原来那只小猫怪，是爷爷安培晴明的式神——腾蛇红莲。
　　虽然恢复了法力，昌浩作为阴阳师还十分稚嫩。于是他立下宏愿，发誓要超越爷爷，成为最强的阴阳师。他和同伴腾蛇红莲一起，走上了修行之路……

　　悪・即・斬！！
　　“戦災”という名のもう一つの戦争――。
　　戦争があった―。敵対するフロスト共和国との永きに渡る戦乱……。停戦が結ばれて三年の月日が流れたにもかかわらず、国民の困窮はいっこうに解消されてはいなかった。事態を憂慮した軍上層部は、飢餓、疫病、野盗化兵といった“戦災”からの復興を任務とする部隊 ― 陸軍情報部第3課を設立する。帝国の不穏な状況、貧者の反発にも屈せず、貴族の誇りにかけて復興を成し遂げようと日々奮闘するアリス少尉。そして、謎の極秘部隊への所属暦を持つ、驚異的な戦闘能力を有するオーランド伍長。心に深い傷を負う彼は、新たな環境下、仲間たちとの交流を通じて“戦災”と対峙し、自らの進むべき道を模索していく・・・。社会を覆う欺瞞と腐敗の分厚い皮を、切り裂き、中身を暴き出す―。
　　ゆえに彼らは自らをこう名乗る。｢パンプキン・シザーズ｣と！

　　近未来的东京，有着一个为了夺取“最强武器”而建立的两大组织，以开发最强兵器为目的的导示重工，和通过操控遗传因子来制造优秀人类的NSWF。他们的共同目的只有一个，就是得到那个拥有着最强威力、并且只有通过被选中的女人才能操纵的终极武器“WITCHBLADE”。地震灾害的6年之后……天羽雅音、梨穂子 ，两人幸福的生活着，但是，等待着她们的却是，WITCHBLADE那暗之力的召唤，以及异常残酷的命运……