故事发生在一间风格十分复古华丽的老式洋馆中，你是公寓的管理员，在那里，命运的邂逅等待着你。 运动细胞非常发达，看上去冷酷无情但是实际上十分温柔的苇原巧（前野智昭 配音）、小小年纪就已经是出色演员，一边演戏一边念书的仁科葵（花江夏树 配音）、身为著名企业的高管，个性十分严厉甚至稍稍有些施虐倾向，可是又存在着善解人意稳重可靠的一面的宫坂真也（鸟海浩辅 配音），居住在公寓里的，是这样三名性格迥异的男子。每一天，你看着他们进进出出，你们之间，会碰撞出怎样的火花呢？
在与暗之科学王国的战斗之后，千空一行人以让史丹利等人占领珀耳修斯号为代价，成功捕获了杰诺。为了躲避猛烈追击，千空一行人以石化光线发源地南美为目标启程！ 千空与杰诺决定短暂联手，结合彼此的知识，共同逼近那令人憎恶的「光」的真相！ 为了拯救人类的未来，千空将与伙伴们携手，全力开拓属于他们的「科学之道」！！
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