故事的地点发生在这个整年都会不可思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。
　　梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，变成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此时，他的两个妹妹，两年前离去的朝仓音梦..

　　为了继承父亲帝野熊五郎（小山力也 配音）的遗嘱，高中生帝野将悟（樱井孝宏 配音）进入了贵族学校深流院学园学习如何成为一个合格社长，不仅如此，在接下来的两年中，将悟还必须在学园中找到可以托付一生的结婚伴侣。这可难倒了个性普通的将悟，不过，世上无难事，将悟愉快的高中生活就要开始了。
　　在生日的当天，将悟接到了一个自称是“妹妹”的女孩打来的电话，然而这位妹妹究竟是谁，将悟毫无头绪。在学园中，将悟结识了许多可爱的女孩子，有学级委员鹤真心乃枝（石原夏织 配音），沉默害羞的神凪雅（佐仓绫音 配音），高智商少女嵯峨良芽衣（日高里菜 配音）等人，而将悟感觉到，那个神秘的妹妹，就藏在这些花朵般柔软的女孩子们之中。

　　在一次护送公司机密文件的途中，旭日重工的普通职员冈岛绿郎（浪川大辅 配音）遭到了名叫黑礁商会的神秘组织的袭击和绑架，机密文件亦被夺走。为了保证秘密不被泄露，旭日重工采取了消抹行动——包括文件和冈岛绿郎本人。在得知了自己被公司抛弃的消息之后，冈岛决定用自己的方式为自己谋得一条生路。冈岛向黑礁商会提出了入会的要求，并通过实际行动证明了自己的能力，之后以“洛克”之名开始全新的生活。
　　精明冷静的首领达奇（礒部勉 配音），个性刚强的双抢手薇拉（丰口惠美 配音），开朗淡泊的机械师本尼（平田广明 配音），在这些神秘人物的围绕下，洛克逐渐找到了同伴的感觉，同时，一条充满了危机与冒险的道路也在他的面前展开了。

　　教会历526年——。世界上有魔女存在，“魔术”也得到普及。然而，世界还并未知晓“魔法”的存在。在这样的时代里，还有着被人们蔑称为“堕兽人”的半人半兽的佣兵。他就这样每日被魔女觊觎着，还梦想着能成为人类，直到某天在森林中遇到的美丽魔女改变了他的命运。“——想变回人类吗？那么佣兵，成为吾辈的护卫吧！”自称为零的魔女说自己的【零之书】——一本一旦使用不当甚至可能毁灭世界的魔法书不知被谁盗走，现正在寻找这本书的旅途中。佣兵以零使用力量帮助他成为人类为条件，接受了成为自己最讨厌的魔女的护卫的要求。围绕着禁断的魔法书，人们的思绪开始纷乱交错……。
　　高贵的魔女与温柔的兽人所带来的极上幻想剧。

《百花缭乱 武士少女》是日本ホビージャパン（Hobby JAPAN）出版社创业40周年的跨媒体制作企画。该企画的小说作者为日本的编集者、著作家·铃木ドイツ（すずきあきら）【铃木晓】。同时TV动画也预计在2010年10月开始在独立UHF局以及AT-X电视台播放。但在2010年9月3日在TOKYO MX电视台先行播放了第一话。
故事发生在21世纪初叶的日本，此时的年号是“平诚”。虽然锁国政策已经完结，但德川幕府的统治还在继续。在富士山的山脚有一间巨大教育机构·武应学园塾。这里的部分学生对德川家进行反抗，学生会执行部称其为“丰臣狩猎”，并对其进行镇压。本作的主人公、柳生道场的代理师傅·柳生宗朗虽世代为德川效力，但他却对执行部的镇压行动抱有疑问，为此却被学生会命令撤走道场。撤走期限即将来临之际的一天晚上，宗朗与真田幸村后藤又兵卫被学生会直辖部队追杀逃进柳生道场秘密房间后，突然从天空堕下一名手持双刀的全裸美少女。自称柳生十兵卫三严的少女击退了强袭道场的服部忍者，从此之后，就有众多日本历史上的武将以少女身份出现在宗朗面前。

　　花园百合铃（大森日雅 配音）是一个标准的中二少女，虽然已经升入了大学，还整日里一副哥特萝莉的打扮，虽然右眼带着眼罩，但实际上视力毫无问题。表面看来，百合铃有些古怪和难以接近，可实际上，她对待朋友非常的热情友善。一次偶然中，百合铃竟然从魔界里召唤出了恶魔邪神酱（铃木爱奈 配音），她可是那里里地位最崇高的恶魔。
　　邪神酱一心想要回到魔界，而回去的唯一方法就是杀死她的召唤者百合铃，可是实际上，邪神酱是一个笨手笨脚的废柴，每当她设计想要袭击百合铃时，总是会被后者在有意无意之中一招化解。除了邪神酱外，美杜莎（久保田未梦 配音）、佩柯拉（小坂井祐莉绘 配音）等恶魔也降临人间。

　　这里是空中漂浮着众多岛屿的空之世界。在信奉神秘的岛屿“赛克汀瑟”上生活的少年格兰，以及会说话的羽蜥碧，某天，遇见了谜之美少女——露莉亚。露莉亚，是从企图以强大的军事力量支配这个空之世界的军事国家艾尔斯提帝国那里逃来的。格兰与露莉亚为了逃离帝国，带着格兰的父亲留下的写有“在星之岛伊斯塔鲁西亚等着”的书信，展开了前往壮大天空的旅程。格兰，在赛克汀瑟岛和羽蜥碧一起生活的少年。以失踪了的父亲留下的书信写着的“星之岛，伊斯塔鲁西亚”为目标，平时总是日不间断地锻炼，爱向有困难的人伸出温暖的援手。以跟露莉亚的相遇为契机，离开故乡踏上旅途。露莉亚，拥有驾驭星晶兽的能力的少女。被试图研究这种特殊能力的艾尔斯提帝国幽禁起来。从帝国逃脱过程中被格兰所搭救，和他一起踏上旅途。碧，从格林小时候开始就伴随其左右一起生活，如同搭档般的存在。喜欢吃苹果。讨厌被别人当作蜥蜴和小动物对待。卡塔莉娜·亚莉泽，艾尔斯提帝国的骑士。曾经担任露莉亚的护卫和监视工作，但是知道了帝国是想利用露莉亚来获取强大的力量一事后，向帝国举起了反旗。把露莉亚当作妹妹一样重视。拉卡姆，操纵飞渡天空的飞艇“骑空艇”的精明能干的操舵士。受到过去的事故的打击而拒绝再乘上骑空艇。虽然看似很粗鲁的一个人，实际上是很会照料别人，也有好管闲事的一面。

　　ある時、最古の神竜が人間に討たれた。
　　悠久の時を生き、神々すらひれ伏す絶大な力を持つその竜は、孤独と共に己の死を受け入れた。
　　しかし、次に気がついた時、竜は辺境の村人ドランとして第二の生を受けていた。
　　人間として竜よりずっと短い生を生きることになった彼は、畑仕事に精を出し、食を得るために動物を狩る……。
　　質素ながらも温かい村での生活に、ドランの心は竜生では味わえなかったささやかな喜びで満たされていく。
　　しかし、そんなある日、沼地の調査に出かけたドランの前に、セリナと名乗る半人半蛇のラミアが現れた。
　　伴侶を探して旅をしている彼女は、ラミアなのに人間を誘惑するのが苦手だという。
　　人と魔物、相容れぬ存在ながらも次第に心を通わせていく二人。
　　だが、二人の前には様々な外敵が現れて――!?
　　辺境から始まる、元最強最古の竜の“生き直し”ファンタジー！

　　表面看来，砂户太郎（福山润 配音）不过是一介普通少年，但在那人畜无害的面孔之下，隐藏着极为扭曲的个性，没错，砂户太郎是那种一旦被女性粗暴对待就会兴奋的浑身发抖的超级受虐狂！砂户太郎一直深深爱恋着被称为“志穗璃公主”（佐藤利奈 配音）的神秘女子，为了成为能够配得上公主的人，砂户太郎决定好好的进行一番自我修炼，就这样，他来到了传说中能够实现愿望的第二义工社。
　　迎接砂户太郎的，是名为石动美绪（竹达彩奈 配音）的金发女子，在她娇俏可人的外表之下，隐藏着专横跋扈残暴无理的一面。此外还有外冷内热的紫发少女结野岚子（早见沙织 配音），在一连串匪夷所思的意外事件之后，砂户太郎对于自己是否真的能够完成心愿产生了深深的怀疑。

　　女高中生相泽智对自己的青梅竹马久保田淳一郎说出“我喜欢你！”的表白，对方却以为是“挚友”的宣言，“充满男子气概”的女孩子想被喜欢的人“当成女生”看待，结果总是加深两人的男子友情，环绕两人的恋爱喜剧。

　　“我第一次在夜里，没跟任何人说就出来了。”
　　讨厌女生的初中二年级学生夜守光，现在不知为何不去上学了。
　　而且，每天晚上都睡不着觉。
　　有一天，小光第一次在夜里没告诉任何人就出去了。 夜风怡人，自由自在，与白天完全不同。小光发现夜晚才是他的归宿。
　　这时，神秘的美少女七草荠突然出现。 她是夜晚的居民·吸血鬼。 荠告诉小光夜晚的乐趣。
　　“熬到今天满意为止吧，少年。”
　　夜晚，被荠迷住的小光向她请求。
　　“请把我变成吸血鬼。”
　　荠告诉了他成为吸血鬼的方法。羞怯地说。那就是……
　　“人类爱上吸血鬼！”
　　究竟不懂恋爱的小光，会不会和荠恋爱，并成为吸血鬼呢！？
　　两个人的特别的“约会”开始了——