与昔日的同学分别后，主角南云始率领的队伍前往大迷宫获得新的神之魔法。一个突破各种考验，稳步强化回归原始世界的队伍。 然而，在幕后，恶魔们也表现出了令人不安的动作。一个影子潜入王都和一个神秘的人死亡。杀死所有敌人——即使是神明”站在他们面前的真正敌人是谁？！？最强”异世界 奇幻，第二季正式开幕！
在与暗之科学王国的战斗之后，千空一行人以让史丹利等人占领珀耳修斯号为代价，成功捕获了杰诺。为了躲避猛烈追击，千空一行人以石化光线发源地南美为目标启程！ 千空与杰诺决定短暂联手，结合彼此的知识，共同逼近那令人憎恶的「光」的真相！ 为了拯救人类的未来，千空将与伙伴们携手，全力开拓属于他们的「科学之道」！！
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