生长于伊豆小镇的小日向光，以及从东京搬来的大木双叶。一同进入梦丘高中的两人，在呼吸器潜水以及日常的平凡事件当中，找到了很多的幸福。曾经对任何事都很消极的双叶，在总是开朗乐观的光的影响下，经历了很多向前踏出一步的喜悦。不止如此，双叶还在期盼已久的开放水域潜水员实习中合格，接下来将要以进阶开放水域潜水员为目标。仅此一次、无可替代的高中生活，现在才正要开始。美妙的日子仍未结束，两人一同走过的日子还要一直继续。
在与暗之科学王国的战斗之后，千空一行人以让史丹利等人占领珀耳修斯号为代价，成功捕获了杰诺。为了躲避猛烈追击，千空一行人以石化光线发源地南美为目标启程！ 千空与杰诺决定短暂联手，结合彼此的知识，共同逼近那令人憎恶的「光」的真相！ 为了拯救人类的未来，千空将与伙伴们携手，全力开拓属于他们的「科学之道」！！
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