大内库藏武功秘笈《葵花宝典》失窃。东厂主管太监古今福（刘洵 饰）率千户欧阳全（张学友 饰）等，南下调查辞官锦衣卫林镇南，同时收用“五岳盟主”左冷禅（元华 饰）外围策应。华山派大弟子令狐冲（许冠杰 饰）与师妹岳灵珊（叶童 饰）奉师命增援林镇南，无奈两人实力不济，领得林镇南遗嘱后遁走，二人于路先后巧遇顺风堂堂主刘正风（午马 饰）、日月神教长老曲洋（林正英 饰）、华山派风清扬，获传《笑傲江湖》曲谱和独孤九剑。
　　各路人马为《葵花宝典》纷纷聚于苗人地界，欧阳全与左冷禅争功不下，遂假扮林平之混入华山派一行。令狐冲结识日月神教任盈盈（张敏 饰）与蓝凤凰（袁洁莹 饰），因曲洋之关系得其协助。古今福与岳不群为《葵花宝典》大打出手，令狐冲不忍一班师兄弟受牵连愤而使出独孤九剑，始明了“笑傲江湖”真意。
　　本片根据金庸同名小说改编。

　　国际刑警联合泰国军队，火烧金三角中断毒品来源，黑帮、毒臬联手报复，派人潜入刑警档案室，盗取刑警档案，刑警每出动一人，便即遭暗杀，黑帮为补偿损失，进行一名为“黑色十字”计划，刑警苦无良策下，得美国毒品调查可资助，雇请织协助对抗，惟是黑帮人强马壮，织只能智取抗敌，一场海、陆、空大决战便即时爆发。

　　云飞扬（徐少强 饰）表面上不过是一介小小杂役，但实际身份却是武当掌门青松（王戎 饰）的私生子，私底下，青松传授了云飞扬诸多的武艺。青松有一宿敌独孤无敌（万梓良 饰），两人交手多年没有分出高下。
　　青松新收了一名为傅玉书（刘永 饰）的弟子，哪想到玉书其实是青松之敌逍遥谷主人的孙子，他此行只有一个目的，那就是偷师学艺为亲复仇。玉书杀害了青松霸占其位，并将罪名嫁祸到了云飞扬的头上，一时间，云飞扬成为了江湖上人人喊打的逆贼，他不得不踏上了逃亡的旅程。途中，云飞扬身负重伤被一女子救下，这位女子不是别人，竟是他同父异母的妹妹。人生跌入谷底的云飞扬决定痛定思痛，苦心修炼来之不易的天蚕功，希望能够为生父报仇。

　　清朝年间，少林与武当都拥有极多高手。少林以反清复明为志，武当派则甘作满清鹰犬，因而两派处于敌对局面，旗人青年童千斤，因自幼是孤儿，遭受同族欺侮，对族人怀恨极深，投身少林寺习武。他联络同门师兄弟胡惠乾等进行反清复明工作，武当派高手为了对付少林弟子，亦派出门下分批下山，与童相遇掀起一场又一场的打斗……

　　舂米六（洪金宝 饰）的叔父惨死于满洲人手下，舂米六发誓要替叔父报仇。在三德和尚（陈星 饰）的带领之下，舂米六进入少林寺修习武艺，很受师傅静尘（黄枫 饰）赏识。舂米六报仇心切，知道自己闯不过木人巷，于是决定偷偷潜出少林寺，形迹败露，面临寺规惩戒，所幸惩戒他的是师兄谢亚福（田俊 饰），很快舂米六就获得了下山的许可。
　　牛精良（卢海鹏 饰）面恶心善，是染布厂的机房工人，纨绔子弟白安福（冯克安 饰）长着自己身为满洲人的兄长在市内横行霸道为非作歹，奸污了牛精良貌美如花的妹妹，使其含恨自杀。悲愤交加的牛精良决心替妹妹报仇。

　　四大家族之一的金虎堡堡主在一次押镖途中，被四名蒙面和尚劫杀。叶青花被怀疑与此案有关，游侠雷迅助友洗脱嫌疑，竟卷入奇案，三闯少林找出四名和尚，当众伏法，以为真相大白；岂料，四名和尚又到处杀人，雷迅才知道被人利用，引发连场打斗。

　　满清入主中原后，有讳于汉族民众以武术造反，严禁民间习武。少林本也应列禁例之内，但有鉴于寺中弟子皆武艺高强，清廷于是命少林选派弟子，教授八旗官兵武艺。然而有一将军（王龙威饰）深觉少林终乃清廷心腹大患，又不满于其隐匿寺中武僧，仅指派俗家弟子前往授艺，终生挑拨南北少林两家，另双方自相残杀以剿少林之念。

　　三十年代旧上海，各方势力纠结，错综复杂。乡下青年小虎（元彪 饰）来至上海，寻找在英租界担任军官上校的哥哥大虎（林子祥 饰）。然抵达当晚便遭遇一场枪战火拼，双方为了一笔巨额的海外捐款大打出手，死伤无数。
　　在新结识的马戏团好友帮助下，小虎成功找到哥哥。大虎为人正直，疾恶如仇，但在这样的乱世他的力量微薄。由于无力铲除租界内的毒品走私活动，他被上司派去保护巨鳄金爷（洪金宝 饰）从海外归来的干女儿宋璧君（梅艳芳 饰）。宋曾是大虎的恋人，如今为追查失踪的捐款潜回上海。爱情、友情、亲情以及国家道义，在旧上海发生了激烈的碰撞……

　　街市无赖韦小宝（汪禹 饰）阴差阳错进了宫，意外还和康熙皇帝（刘家辉 饰）打成一片，成了死党。随后，他更成了康熙的忠臣，帮康熙出谋划策，除掉了心腹大患鳌拜，一时官至极品，曾经的街市无赖终于出人头地。小宝也并非事事顺利，因其曾受天地会舵主陈近南所救，拜了陈近南为师傅，所以他在宫内的一大任务就是帮助天地会取得太后那里的四十二章经。由于四十二章经关系重大，除了天地会、神龙教，甚至康熙都想查出其下落，小宝就在各方势力下鬼马周旋，最后更凭借其聪明才智成功脱身。

　　魔山派秦五新(白彪饰)连败九十九名剑手，终在最后一击败在剑神(王戎饰)手上。五新杀死著名铸剑师老鹰(谷峰饰)夺取其宝剑 ，老鹰之子燕北(尔冬升饰)矢志为父报仇。

　　「锦衣卫」为明皇帝直接管轄之特务机关，负責巡察緝捕乱黨。時英宗昏庸无能，大权落入宦官王振（刘永）之手，他操纵锦衣卫，利用它诛杀异己，残害忠良；然锦衣卫统领赵不凡（梁家仁），却是一心保国卫民的忠臣，在连续几次暗杀行动中，义释忠良。在王振的威胁下，身为锦衣卫总管的赵父无奈被迫追杀亲儿子…

　　王凤仪（王祖贤 饰）的父亲王冬（付宏达 饰）是全兴社的老大，而王凤仪却爱上了身为警察的吕建达（林俊贤 饰），两人之间虽然感情十分要好，但身处的立场和地位不同，两人时常会爆发矛盾与争吵。督查钟秋月（莫少聪 饰）是吕建达的好友，他也被王凤仪的善良和美丽所吸引，不可自拔地坠入情网。 王冬最终还是锒铛入狱，无奈之下，他的社团只得由王凤仪来继承。王凤仪不希望社团再做违法的勾当，遭到了帮派里各头目的反对。何世昌（龙方 饰）曾是王冬的手下，一直觊觎王凤仪的美貌，终于找到机会将她玷污。钟秋月得知真相想替王凤仪报仇，没想到却惨遭暗算。